A Polícia Federal, em suas investigações, aponta Filipe Martins como um dos responsáveis pela elaboração de um suposto golpe de Estado no final do governo Bolsonaro. Em decorrência disso, ele encontra-se detido desde o dia 8 de fevereiro para averiguações mais aprofundadas.
Durante o depoimento prestado em fevereiro, apesar de se recusar a responder algumas perguntas alegando falta de acesso ao inquérito, o ex-assessor negou veementemente ter participado da elaboração do documento golpista e afirmou estar no Brasil no final de 2022. Segundo ele, fez uma viagem de Brasília para Curitiba no dia 31 de dezembro de 2022, desmentindo assim a suspeita de que teria deixado o país no avião presidencial com Bolsonaro rumo a Orlando, nos Estados Unidos, nos últimos dias do mandato do ex-presidente.
O ministro Alexandre de Moraes, relator das investigações, está apurando essa suspeita e solicitou à administração do Aeroporto de Brasília imagens do embarque de Filipe Martins, bem como informações sobre o voo à companhia aérea Latam. A defesa de Martins, por sua vez, enviou um comprovante de embarque no dia indicado no depoimento para comprovar sua versão dos acontecimentos.
É importante ressaltar que as investigações estão em andamento e ainda não há conclusões definitivas sobre o envolvimento de Filipe Martins nos eventos mencionados. O desenrolar desse caso certamente terá desdobramentos importantes na política nacional.